Vaginite et flore vaginale : ce qui est normal et quand consulter
À retenir
Chez beaucoup de femmes en âge de procréer, des bactéries protectrices — les lactobacilles — aident à garder un pH vaginal acide. La vaginite désigne un ensemble de symptômes (pertes inhabituelles, odeur, démangeaisons ou brûlures) qui peuvent venir d'une vaginose bactérienne, d'une mycose, d'une trichomonase, d'une irritation ou d'un manque d'œstrogènes. Ces tableaux se ressemblent souvent : l'histoire clinique, l'examen et des tests adaptés valent mieux que l'autodiagnostic. La seule présence de Gardnerella sur un prélèvement ne justifie pas d'antibiotiques sans critères cliniques.
Sources clés : Lignes directrices du CDC sur la vaginose bactérienne ACOG Practice Bulletin n° 215 : Vaginite chez la patiente non enceinte Liu et al. 2025 — revue sur la vaginose bactérienne et la dysbiose microbienne
Le vagin abrite une communauté changeante de micro-organismes — la flore, ou microbiote vaginal. Chez beaucoup de femmes en âge de procréer, les lactobacilles aident à garder un milieu acide. D’autres profils existent aussi sans symptômes. Un compte rendu de laboratoire ne suffit donc pas à classer une flore comme « saine » ou « pathologique ».
Une modification du microbiote, une infection, une irritation ou un manque d’œstrogènes peuvent provoquer des pertes inhabituelles, des démangeaisons, une odeur ou des brûlures. Savoir que ces symptômes ont plusieurs causes possibles aide à éviter un traitement inadapté.
Ce que fait une flore vaginale normale
Un microbiote riche en lactobacilles peut comprendre Lactobacillus crispatus, L. jensenii ou L. gasseri. Ces bactéries participent à la production d’acide lactique et au maintien d’un pH vaginal acide : chez la femme en âge de procréer, le pH est en général égal ou inférieur à 4,5 (recommandations du CDC sur la candidose).
Une telle flore peut contribuer à :
- freiner certaines bactéries anaérobies (qui se développent sans oxygène) associées à la vaginose bactérienne,
- produire des métabolites et des substances antimicrobiennes qui modulent la communauté microbienne,
- soutenir la muqueuse vaginale.
Rien n’est figé. La flore varie au fil du cycle menstruel, pendant la grossesse, après les rapports, sous antibiotiques et, après la ménopause, avec l’évolution des taux d’œstrogènes.
Ce que signifie une vaginite : signes et manifestations
La vaginite est un terme clinique général qui désigne une inflammation ou une infection du vagin. Ce n’est pas une maladie unique, mais un tableau qui peut avoir des origines très différentes (Bulletin pratique ACOG n° 215).
On observe souvent :
- un changement de couleur, de volume ou de consistance des pertes vaginales,
- des démangeaisons vulvaires ou vaginales persistantes, des brûlures ou des rougeurs,
- une odeur désagréable ou inhabituelle, souvent décrite comme une odeur de poisson,
- une gêne ou une douleur pendant les rapports (dyspareunie),
- des brûlures en urinant (dysurie), souvent quand l’urine touche une peau vulvaire irritée.
Des affections différentes peuvent donner des sensations très proches : les symptômes ne suffisent donc pas toujours à en identifier la cause. D’où l’importance de l’histoire clinique et de tests adaptés.
Causes courantes : de la dysbiose aux infections
Lors du bilan, on recherche surtout ces tableaux :
La vaginose bactérienne (VB) est la cause la plus fréquente de pertes anormales chez la femme en âge de procréer. Il ne s’agit pas d’un germe « extérieur » unique, mais d’une dysbiose, c’est-à-dire d’un déséquilibre de la flore. Les lactobacilles protecteurs reculent et un ensemble d’anaérobies (Gardnerella vaginalis, Atopobium vaginae, Prevotella) se multiplie. La vaginose donne souvent des pertes fluides, grisâtres ou blanchâtres, une odeur d’amines (« odeur de poisson ») et un pH supérieur à 4,5.
La candidose vulvo-vaginale (mycose) est une prolifération de levures, le plus souvent Candida albicans. Elle provoque habituellement des démangeaisons vulvaires intenses, des brûlures, une rougeur et des pertes blanches, épaisses et grumeleuses (comme du lait caillé). Point utile pour le diagnostic : dans les formes non compliquées, le pH vaginal reste en général normal (≤ 4,5).
La trichomonase est une infection sexuellement transmissible due au protozoaire Trichomonas vaginalis. Les signes vont d’une gêne légère à des pertes abondantes, verdâtres ou jaunâtres, parfois mousseuses, avec une forte irritation vulvaire et un col piqueté de petites hémorragies (« col framboisé »). Le pH est le plus souvent élevé (au-dessus de 4,5).
Le syndrome génito-urinaire de la ménopause (vaginite atrophique) survient quand les œstrogènes chutent : le plus souvent après la ménopause, mais aussi pendant un allaitement prolongé ou sous traitement anti-œstrogène. La muqueuse s’amincit, le glycogène (un sucre de réserve) diminue et les lactobacilles reculent. Sécheresse, tiraillements et brûlures peuvent alors apparaître sans infection active.
L’irritation ou dermite de contact peut venir de savons agressifs, de douches vaginales, de lingettes parfumées, de préservatifs ou de lubrifiants. Les tissus s’enflamment alors que les prélèvements restent négatifs.
Pour comparer les deux motifs de consultation les plus fréquents, voir pertes, démangeaisons, odeur : mycose ou vaginose bactérienne ?
Pourquoi l’évaluation médicale est essentielle
Il est compréhensible de penser à une mycose dès que les démangeaisons commencent. Mais si la cause est une vaginose, une trichomonase ou une irritation, un antifongique ne la traitera pas et peut retarder la bonne évaluation.
En consultation, on croise l’histoire clinique, l’examen et un ou plusieurs tests. Aucun résultat isolé ne tranche à lui seul dans tous les cas (recommandations du CDC sur les pertes vaginales) :
- La mesure du pH vaginal. Un pH supérieur à 4,5 est fréquent en cas de vaginose ou de trichomonase, tandis qu’une candidose simple survient en général avec un pH normal. C’est un indice, pas un diagnostic ; une trichomonase peut aussi s’accompagner d’un pH normal.
- L’examen direct au microscope (à l’état frais). Il peut montrer des cellules-clés (clue cells, des cellules vaginales recouvertes de bactéries), des éléments de levure ou des trichomonas mobiles. Un examen négatif n’exclut pas une candidose ou une trichomonase : la microscopie a une sensibilité limitée.
- Le test à la potasse (whiff test). Une goutte d’hydroxyde de potassium (KOH à 10 %) peut libérer une odeur d’amines caractéristique en cas de vaginose bactérienne.
- Les tests moléculaires validés (TAAN / NAAT). Ces tests d’amplification des acides nucléiques peuvent rechercher Trichomonas, identifier des espèces de Candida ou analyser des profils bactériens associés à la vaginose lorsque cela est indiqué. Pour la vaginose, ces tests s’adressent aux femmes symptomatiques ; détecter un micro-organisme ne prouve pas toujours qu’il explique les symptômes.
Ce que signifie un « déséquilibre de la flore » ou un résultat Gardnerella
Lire « déséquilibre de la flore » ou « présence de Gardnerella vaginalis » sur un compte rendu peut inquiéter. Ces mentions ne constituent pas, à elles seules, un diagnostic.
La présence de Gardnerella n’est pas synonyme de vaginose bactérienne. La bactérie peut être détectée sans symptômes. Le CDC américain ne recommande pas sa culture pour diagnostiquer une vaginose, car elle manque de spécificité. Les tests moléculaires de vaginose sont réservés aux femmes symptomatiques (recommandations du CDC sur la vaginose bactérienne).
La vaginose peut être diagnostiquée par au moins trois des quatre critères d’Amsel : pertes fluides et homogènes, pH supérieur à 4,5, test à la potasse positif et cellules-clés au microscope. Un score de Nugent compris entre 7 et 10 à la coloration de Gram (un frottis coloré lu au microscope) permet aussi de la diagnostiquer (recommandations du CDC sur la vaginose bactérienne).
Le regard clinique du Dr. Aksoy : Un compte-rendu aide au diagnostic ; il ne prescrit pas le traitement. Si une patiente n’a pas de symptômes et que l’examen ne va pas dans le sens d’une infection, le nom isolé d’un germe peut ne pas justifier d’antibiotiques. Le résultat doit être replacé dans le tableau clinique. C’est la patiente que nous soignons, pas la feuille de laboratoire.
Faut-il traiter le partenaire ?
La réponse dépend du diagnostic établi :
- Trichomonase. Le ou les partenaires sexuels actuels doivent être traités en même temps, avec abstinence jusqu’à la fin du traitement et la disparition des signes cliniques (recommandations du CDC sur la trichomonase).
- Candidose non compliquée. Aucun traitement systématique du partenaire masculin n’est requis : la mycose n’est pas considérée comme une IST.
- Vaginose bactérienne. Les recommandations du CDC de 2021, toujours en vigueur, ne préconisent pas le traitement systématique du partenaire (recommandations du CDC sur la vaginose bactérienne). Dans un essai randomisé de 2025 (participants répartis au hasard entre différents traitements) mené chez des couples hétérosexuels monogames, la récidive à 12 semaines était de 35 % lorsque le partenaire masculin recevait en même temps un traitement oral et local, et de 63 % sinon (Vodstrcil et al. 2025). La mise à jour 2025 de l’ACOG indique que ce traitement doit être envisagé chez les partenaires masculins d’adultes atteintes de vaginose récidivante et symptomatique (ACOG 2025), et la mise à jour 2026 de l’ISSVD soutient un traitement sélectif après un diagnostic confirmé (ISSVD 2026). Les analyses groupées publiées en 2026 aboutissent à des conclusions différentes (Aliyu Attahir et al. 2026 ; Gardella et al. 2026). Le traitement du partenaire reste donc une option à décider avec le médecin pour certains cas récidivants, à ne pas commencer seul.
Le traitement dépend du diagnostic confirmé
Le traitement s’adapte à la cause confirmée ou la plus probable. Les schémas ci-dessous sont des exemples issus des recommandations, pas des consignes d’automédication :
- Vaginose bactérienne. Le CDC cite le métronidazole oral, le gel vaginal de métronidazole et la crème vaginale de clindamycine parmi les options. Le choix dépend notamment de la grossesse, de la tolérance, des interactions et du contexte clinique (recommandations du CDC sur la vaginose bactérienne). Le CDC précise que les données ne confirment pas une réaction de type disulfirame avec l’alcool ; il faut malgré tout suivre l’avis du prescripteur et la notice du produit.
- Candidose (mycose). Le traitement peut faire appel à un azolé local (un antifongique) ou, chez certaines patientes qui ne sont pas enceintes, au fluconazole oral. Attention pendant la grossesse : les recommandations du CDC retiennent uniquement un azolé local pendant 7 jours. Le fluconazole oral ne doit pas être utilisé (recommandations du CDC sur la candidose). Pendant la grossesse, le traitement se fait sous contrôle médical.
- Trichomonase. Un nitro-imidazolé oral est nécessaire, ainsi que le traitement des partenaires actuels. Le médecin prescrit le schéma exact.
- Syndrome génito-urinaire de la ménopause. Des hydratants vaginaux ou un traitement hormonal local peuvent être envisagés après une évaluation individuelle.
- Irritation de contact. La première étape consiste à retirer le produit suspect. Des symptômes persistants ou importants nécessitent un examen : infection et affection cutanée peuvent se ressembler.
Impact sur la fertilité, la FIV et la grossesse
Une mycose vaginale simple n’est pas connue pour endommager les trompes. La vaginose, surtout lorsqu’elle est symptomatique pendant la grossesse, mérite une évaluation clinique :
- Pendant la grossesse. La vaginose symptomatique est associée à des complications, notamment la rupture prématurée des membranes et l’accouchement prématuré. Elle doit être évaluée et traitée (recommandations du CDC sur la vaginose bactérienne). Le CDC ne recommande pas le dépistage systématique des femmes enceintes asymptomatiques, y compris à risque élevé de prématurité, car les essais donnent des résultats contradictoires.
- En parcours de FIV et transfert embryonnaire. Certaines études observationnelles (elles suivent des patientes sans leur attribuer de traitement) associent un microbiote vaginal dominé par les lactobacilles à de meilleurs résultats de FIV, sans démontrer que ce profil en est la cause. L’ESHRE ne recommande pas le profilage du microbiote vaginal ou utérin après des échecs d’implantation répétés.
- Santé utérine. Une dysbiose vaginale n’est pas une endométrite chronique. Un prélèvement vaginal ne diagnostique pas une inflammation de l’endomètre : une suspicion d’endométrite chronique demande une évaluation ciblée distincte.
Conseils pratiques pour préserver sa flore au quotidien
Quelques gestes simples peuvent limiter l’irritation, sans prétendre « améliorer » un résultat de microbiote :
- Laver uniquement l’extérieur (la vulve). Utilisez de l’eau tiède ou un nettoyant doux sans savon (syndet) au pH physiologique. N’introduisez jamais d’eau à l’intérieur du vagin : il se nettoie naturellement.
- Éviter les douches vaginales. Elles sont associées à la vaginose et peuvent favoriser les récidives (recommandations du CDC sur la vaginose bactérienne). Elles ne traitent ni les pertes ni les odeurs.
- Limiter l’humidité et les frottements prolongés. Retirez les vêtements humides s’ils provoquent une irritation. Aucun textile particulier ne garantit une protection contre la vaginite.
- Utiliser les antibiotiques seulement lorsqu’ils sont prescrits. Ils peuvent modifier le microbiote vaginal et doivent répondre à une indication clinique claire.
Questions fréquentes posées au Dr. Aksoy
Le compte rendu indique « shift in flora », « flore modifiée » ou « flore de type 3 », sans aucun symptôme : traitez-vous ?
La mention d’une « modification de la flore » sur un prélèvement vaginal ne signifie pas forcément qu’il existe une infection à traiter. Je regarde d’abord ce que le compte rendu veut dire exactement. « Shift in flora » indique parfois seulement que les lactobacilles ont diminué et que d’autres bactéries ont augmenté. En revanche, une « flore de type 3 » peut, dans certaines classifications, correspondre à une vaginose bactérienne. La classification utilisée et la situation clinique comptent donc.
Chez une femme qui n’est pas enceinte et qui n’a ni démangeaisons, ni mauvaise odeur, ni pertes anormales, ni autre plainte, je ne prescris pas d’antibiotique de routine pour une simple modification de la flore. Un antibiotique inutile peut déséquilibrer davantage le milieu vaginal. De même, sans symptômes, je ne juge pas nécessaire de refaire un test après chaque compte rendu anormal.
Une grossesse, une intervention gynécologique prévue ou un autre risque particulier peuvent changer mon évaluation. Ce qui compte pour moi n’est pas de ramener à tout prix le résultat à la normale, mais de savoir s’il y a vraiment quelque chose à traiter.
Le compte rendu indique « flore normale », mais les démangeaisons et les pertes continuent : que faites-vous ?
Si les démangeaisons, les brûlures ou les pertes anormales persistent, la mention « flore normale » ne clôt pas la recherche. Une culture vaginale standard ne peut pas mettre en évidence toutes les infections ni toutes les causes de gêne vaginale.
Je demande d’abord depuis quand durent les symptômes, quels médicaments ont déjà été utilisés, quels produits d’hygiène intime sont employés et si les symptômes suivent le cycle. Je recherche ensuite, par l’examen, la mesure du pH vaginal et le microscope, une vaginose bactérienne, une mycose et, si besoin, une infection comme la trichomonase. En cas de mycoses à répétition, identifier l’espèce de Candida peut être important.
Si tous les tests d’infection sont normaux, j’envisage les causes non infectieuses : dermatite de contact, irritation liée aux produits utilisés, changements hormonaux ou maladies de la peau de la vulve. Je ne dis donc pas à une patiente « vous n’avez rien » simplement parce que la culture est normale. Mais je ne conseille pas non plus de reprendre des antibiotiques ou des antifongiques sans savoir ce que l’on traite. L’important n’est pas le compte rendu : c’est de pouvoir expliquer la gêne qui persiste.
Si la vaginose bactérienne récidive, traitez-vous aussi le partenaire ? Dans quels cas ?
Ce point a beaucoup évolué ces dernières années. Autrefois, le traitement du partenaire masculin n’était généralement pas recommandé. Un important essai randomisé publié en 2025 a montré que traiter le partenaire masculin par antibiotiques oraux et locaux, en même temps que la femme, peut nettement réduire le risque de récidive.
J’envisage donc désormais ce traitement surtout chez les femmes dont la vaginose est confirmée, dont les symptômes reviennent malgré des traitements adaptés et qui ont des rapports réguliers avec le même partenaire. En revanche, je ne donne pas automatiquement d’antibiotiques au partenaire de toute femme qui fait un premier épisode ou qui n’a aucun symptôme. Je veux d’abord être sûr du diagnostic, des traitements déjà reçus et du lien entre les récidives et les rapports sexuels.
Si le partenaire est traité, il faut tenir compte de l’association orale et locale simultanée qui s’est montrée efficace dans les études, plutôt que de lui donner une seule dose d’antibiotique. J’explique aussi à mes patientes que ces récidives ne signifient pas forcément une infidélité ou une nouvelle contamination, et qu’elles ne sont pas le signe d’une mauvaise hygiène. Le but est de rompre le cycle des récidives tout en évitant les antibiotiques inutiles.
Autres questions sur la flore vaginale et la vaginite
Mes symptômes seuls suffisent-ils à déterminer la cause ?
Non. Pertes, démangeaisons, brûlures et odeurs peuvent se retrouver dans une vaginose, une candidose, une trichomonase, une cervicite ou une irritation non infectieuse. L’histoire clinique, l’examen et des tests adaptés — pH, microscopie, culture ou TAAN selon le cas — aident à identifier la cause.
La vaginose bactérienne est-elle considérée comme une IST ?
Pas au sens d’une IST classique. La vaginose est une dysbiose vaginale. L’activité sexuelle et certains facteurs liés au partenaire peuvent toutefois influer sur le risque ; les données sur la transmission continuent d’évoluer. Elle peut aussi survenir sans activité sexuelle récente.
Peut-on avoir une mycose et une vaginose bactérienne en même temps ?
Oui. Plusieurs affections peuvent coexister. Si les symptômes persistent après un traitement, une nouvelle évaluation est plus utile que de supposer que le premier diagnostic était complet.
Pourquoi les mycoses surviennent-elles souvent après des antibiotiques ?
Les antibiotiques peuvent modifier les communautés bactériennes qui aident habituellement à maintenir Candida en équilibre. Une candidose devient alors plus probable chez certaines personnes. Tout symptôme après un antibiotique n’est pas forcément une mycose.
Quand faut-il consulter un médecin plutôt que d’attendre ?
Consultez s’il s’agit d’un premier épisode de symptômes vaginaux, si vous êtes enceinte, si vous avez des douleurs pelviennes ou dans le bas-ventre, de la fièvre, ou si les symptômes récidivent souvent ou ne s’améliorent pas dans les quelques jours qui suivent le début du traitement.
Sources
- Centers for Disease Control and Prevention. Bacterial Vaginosis - STI Treatment Guidelines. MMWR Recomm Rep, 2021.
- Centers for Disease Control and Prevention. Vulvovaginal Candidiasis - STI Treatment Guidelines. MMWR Recomm Rep, 2021.
- Centers for Disease Control and Prevention. Trichomoniasis - STI Treatment Guidelines. MMWR Recomm Rep, 2021.
- Centers for Disease Control and Prevention. Vaginal Discharge - STI Treatment Guidelines. MMWR Recomm Rep, 2021.
- American College of Obstetricians and Gynecologists. Vaginitis in Nonpregnant Patients: ACOG Practice Bulletin No. 215. Obstet Gynecol, 2020;135(1):e1-e17. doi:10.1097/AOG.0000000000003604.
- American College of Obstetricians and Gynecologists. Concurrent Sexual Partner Therapy to Prevent Bacterial Vaginosis Recurrence. Obstet Gynecol, 2025;146(6):e111-e114. doi:10.1097/AOG.0000000000006102.
- Vieira-Baptista P, Stockdale CK, Sobel JD. Partner treatment in women with bacterial vaginosis: an update to the International Society for the Study of Vulvovaginal Disease (ISSVD) recommendations. Sex Transm Infect, 2026;102(3):195-197. doi:10.1136/sextrans-2025-056813.
- Aliyu Attahir Z, et al. Male Partner Treatment for Bacterial Vaginosis: A Systematic Review and Meta-Analysis of Randomized Trials. Sex Transm Dis, 2026;53(11):846-852. doi:10.1097/OLQ.0000000000002368.
- Gardella B, et al. Rethinking Prevention of Recurrent Bacterial Vaginosis: A Comparative Effectiveness Network Meta-Analysis. J Low Genit Tract Dis, 2026;30(4):325-340. doi:10.1097/LGT.0000000000000966.
- Liu D, Zhang X, Zhao X, Che X, Song W, Wu G. Bacterial vaginosis: advancing insights into microbial dysbiosis. Crit Rev Microbiol, 2026;52(1):159-175 (Epub 2025). doi:10.1080/1040841X.2025.2537923.
- Vodstrcil LA, et al. Male-Partner Treatment to Prevent Recurrence of Bacterial Vaginosis. N Engl J Med, 2025;392(10):947-957. doi:10.1056/NEJMoa2405404.
- ESHRE Working Group on Recurrent Implantation Failure. ESHRE good practice recommendations on recurrent implantation failure. Hum Reprod Open, 2023;2023(3):hoad023.
- Powell AM. Overview of Vaginitis (Vulvovaginitis). MSD Manual Professional Edition, full review July 2026.
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